Alates pandeemia algusest on diagnostiline testimine mänginud olulist rolli SARS-CoV-2, põhjustava viiruse leviku tõkestamisel.COVID 19.Antigeeni kiirtestidkodus või kliinilises keskkonnas teostatud tulemused annavad tulemuse 15 minutiga või vähem.Mida varem inimesel diagnoositakse, seda kiiremini saab ta pöörduda arsti poole ja isoleerida end teistest.Kuid kui ilmnevad viiruse uued variandid, ei pruugi need testid neid variante tuvastada.
Enamik antigeeni kiirteste on loodud SARS-CoV-2 nukleokapsiidi valgu või N-valgu tuvastamiseks.Seda valku leidub ohtralt viirusosakestes ja nakatunud inimestes.Kiirtesti komplekts sisaldavad tavaliselt kahte erinevat diagnostilist antikeha, mis seonduvad N-valgu erinevate osadega.Kui antikeha seondub proovis oleva N-valguga, ilmub testikomplektile värviline joon või muu signaal, mis viitab infektsioonile.
Valk N koosneb 419 aminohappe struktuuriüksusest.Kõiki neist saab mutatsiooni teel asendada teise aminohappega.Uurimisrühm eesotsas Ph.D.Philip Frank ja Eric Ortlund Emory ülikoolist asusid uurima, kuidas see üksainus aminohappe muutus mõjutab antigeeni kiirtesti toimivust.Nad kasutasid tehnikat, mida nimetatakse sügava mutatsiooni skaneerimiseks, et samaaegselt hinnata, kuidas iga viiruse N-valgu mutatsioon mõjutab seondumist diagnostilise antikehaga.Nende tulemused avaldati Cellis 15. septembril 2022.
Teadlased lõid põhjaliku raamatukogu, mis sisaldab peaaegu 8000 N-valgu mutatsiooni.Need variandid moodustavad enam kui 99,5% kõigist võimalikest mutatsioonidest.Seejärel hindasid nad, kuidas iga variant interakteeris 17 erineva diagnostilise antikehaga, mida kasutati 11 kaubanduslikult saadavas antigeeni kiirtestis, sealhulgas tavalises.kodukomplektid.
Töörühm hindas, millised N-valgu mutatsioonid mõjutavad antikehade äratundmist.Selle teabe põhjal lõid nad iga diagnostilise antikeha jaoks põgenemismutatsiooniprofiili.See profiil tuvastab spetsiifilised mutatsioonid N-valgus, mis võivad mõjutada antikeha võimet seonduda oma sihtmärgiga.Analüüs näitas, et tänastes kiirtestides kasutatavad antikehad tunnevad ära ja seovad kõik murettekitavad ja murettekitavad SARS-CoV-2 varasemad ja praegused variandid.
Kuigi mitmed diagnostilised antikehad tunnevad ära sama N-valgu piirkonna, leidsid teadlased, et igal antikehal on ainulaadne põgenemismutatsioonide signatuur.Kuna SARS-CoV-2 viirus jätkab muteerumist ja uute variantide genereerimist, saab neid andmeid kasutada testikomplekti antikehade märgistamiseks, mida võib olla vaja uuesti hinnata.
"Nakatunud isikute täpne ja tõhus tuvastamine jääb COVID-19 leevendamise kriitiliseks strateegiaks ning meie uuring annab teavet tulevaste SARS-CoV-2 mutatsioonide kohta, mis võivad avastamist segada," ütles Ortlund."Siin kirjeldatud tulemused võimaldavad meil selle viirusega kiiresti kohaneda, kuna uued variandid tekivad jätkuvalt, avaldades vahetut kliinilist ja rahvatervise mõju."
Taust: Mutation Deep Scan tuvastab põgenemismutatsioonid SARS-CoV-2 nukleokapsiidis, kasutades praegu saadaolevaid antigeeni kiirteste.Frank F., Kin MM, Rao A., Bassit L., Liu H, Bowers HB, Patel AB, Kato ML, Sullivan JA, Greenleaf M., Piantadosi A., Lam VA, Hudson VH, Ortlund EA cell.2022 15. september;185(19):3603-3616.e13.Siseministeerium: 10.1016/j.cell.2022.08.010.29. august 2022 PMID: 36084631.
Rahastamine: National Institute for Biomedical Imaging and Bioengineering NIH (NIBIB), Riiklik Diabeedi, Seede- ja Neeruhaiguste Instituut (NIDDK) ja Riiklik Allergia- ja Nakkushaiguste Instituut (NIAID), American Heart Association.
NIH Research Matters on iganädalane värskendus NIH-i peamistest uurimistulemustest, mille on läbi vaadanud NIH eksperdid.Selle avaldab riiklike terviseinstituutide direktori kommunikatsiooni- ja avalike suhete büroo.